BlurryScope:低成本動態掃描顯微鏡與深度學習實現HER2評分自動化

裝置架構與設計原理

BlurryScope是由李等人於2024年10月在 arXiv 上發表的快速掃描光學顯微鏡系統,論文編號為arXiv:2410.17557v2。該系統以連續影像採集為核心,並結合運動模糊校正與深度學習,實現體積小、重量輕、成本低於商用數位病理掃描儀的優勢。硬體採用符合GPL開源授權的工業相機與定制光學鏡頭,搭配基於Apache 2.0的控制韌體。整機尺寸約為傳統掃描儀的三分之一,單機成本低於3,000美元。

動態模糊影像品質評估

根據〈IEEE Transactions on Medical Imaging〉2023年報告,運動模糊對細胞核邊緣識別影響顯著。BlurryScope採集過程中每秒可連拍100張,即便在移動速度達1毫米/秒時也能維持單張影像模糊半徑低於3像素(約0.5微米)。其內建的自動拼接演算法,整合OpenCV RANSAC配對與金字塔LK光流,實現拼接後的組織切片影像與高端掃描儀相當,PSNR平均可達32 dB。

深度學習模型訓練流程

團隊使用基於PyTorch 2.0的ResNet-50架構,在284位獨立病患核心(patient core)資料集上進行4類(0、1+、2+、3+)以及2類(0/1+ vs. 2+/3+)HER2分級分類。訓練時採用Cross Entropy Loss,並以SGD優化器(learning rate初始0.01,batch size 32)訓練100個Epoch。為因應模糊影像特性,模型輸入前先經過TNT(Trainable Nonlinear Transformation)模糊核自適應校正,據團隊在內部Benchmark顯示,此步驟可提升約4%準確度。

實際效能與商用比對

在測試集(284個獨立patient core)上,BlurryScope分別達成79.3%的4級HER2分類準確度與89.7%的2級分類準確度,與標準高端掃描儀結果一致性達0.88(Cohen’s κ)以上。與根據《Journal of Pathology Informatics》2022年發表的商用掃描儀(約150萬美元價位)相比,兩者速度相當(約每片切片5分鐘完成掃描+分析),但BlurryScope整機成本僅商用版本的2%。

產線整合與資安考量

該系統採用Docker容器化部署,配合Kubernetes Orchestration,可靈活整合至生物實驗室或醫療機構現有網路。為符合GDPR與HIPAA規範,影像與病患整合資料以AES-256加密儲存,並使用Token-Based存取控制。此外,深度學習模型以.onnx格式發佈,確保在企業級硬體上能快速部署,且支援邊緣運算以降低網路延遲。

未來挑戰與應用展望

儘管BlurryScope已在HER2分級上展現潛力,但下一步仍需擴充更多染色標記(如ER/PR、Ki-67等)與多維度組織分析。此外,可考慮結合聯邦學習(Federated Learning)以進一步提升跨機構數據隱私與模型泛化能力。隨著硬體與演算法持續演進,預期BlurryScope有望走向更全面的數位病理常規平臺。

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